La prima missione , " Operazione 40", si svolge a Cuba nel 1961. L'obiettivo finale è quello di assassinare il leader cubano , Fidel Castro , durante la Baia dei Porci . I giocatori che completano con successo la missione di vincere un " Sacrifice" o " Morte ai dittatori " trofeo. Altri obiettivi sono di eludere la polizia. Nella missione successiva, " Vorkuta " si deve fuggire da un campo di lavoro russo e proteggere il carattere Reznov , un capitano dell'Armata Rossa , che si allea con Alex Mason . Dopo la fuga da Vorkuta , la terza missione , " USDD " ti porta al Pentagono , dove si sono indirizzati dal presidente John F. Kennedy per eliminare Dragovic , un generale russo , che è una minaccia per la sicurezza nazionale americana . L '" ordine esecutivo " missione si torna in Unione Sovietica , dove , come membro della CIA , è necessario infiltrarsi in un impianto di lancio del missile a Baikonur , distruggere i missili e uccidere Dragovic .
Missioni 5-8
La quinta missione " SOG " si svolge nel sud del Vietnam . Qui dovete salvare agente della CIA Jason Hudson e difendere la città di Khe Sanh contro il Vietnam del Nord . Hai anche di distruggere tutti i carri armati . La missione dal titolo "Il traditore " accade durante l'offensiva del Tet . Il vostro obiettivo è quello di rintracciare un disertore , che si rivela essere Reznov . È inoltre necessario per raggiungere una zona di atterraggio , difenderla , e quindi arrivare ad una barca . La prossima missione , "Numeri ", è impostato a Kowloon , Hong Kong . Qui si deve torturare , ma poi fuggire con , prigioniero dottor Clark e agente della CIA Grigori Weaver. È inoltre necessario fuggire da un Spetsnaz , o dell'esercito sovietico , attacco. "Progetto Nova " l'ottava missione , è un flashback al carcere di Reznov a Vorkuta . Come Reznov , non si prende in una missione tanto quanto il gioco attraverso gli eventi della sua cattura a seguito di una battaglia con l'esercito tedesco .
Missioni 9-12
La nona missione , "Victor Charlie " coinvolge sfuggire al Viet Cong dopo essere sopravvissuto a un incidente di elicottero in territorio nemico . In "Crash Site " missione , l'azione si sposta al confine con il Laos Vietnam . Qui si deve guidare una barca a monte per trovare un aereo cargo sovietico precipitato contenente lanciamissili . Devi distruggere tutti i nemici e tenerli lontano dal luogo dello schianto . In " WMD" è necessario cercare le armi di distruzione di massa in Unione Sovietica e distruggere le strutture dove vengono fatte prima di fuggire in modo sicuro . Per completare la 12 ° missione " Payback " è necessario sfuggire alla cattura da parte del Viet Cong , distruggere le basi sovietiche e uccidere ufficiale russo Kravchenko .
Missioni 13-15
la " Rinascita " missione , è necessario cercare di Friedrich Steiner , e affrontare e ucciderlo . Steiner è l'inventore tedesco del gas nervino Nova 6 che uccide le persone in pochi secondi . Il livello successivo , " Revelations " è simile alla terza missione . Si svolge nella struttura National Security Agency degli Stati Uniti , dove il giocatore , come Alex Mason , viene interrogato e scopre alcune rivelazioni su ciò che è stato coinvolto finora. In ultima missione , " Redemption " l' obiettivo è quello di attaccare la nave russa Rusalka e prevenire Nova 6 di essere rilasciato negli Stati Uniti .